Наблюдения за состоянием пресноводных экосистем на гидробиологической сети Росгидромета проводятся по утвержденным программам и по специальным методам комплексного гидробиологического мониторинга ("Руководство по гидробиологическому мониторингу пресноводных экосистем").

В состав гидробиологических наблюдений входит изучение основных экологических сообществ: фитопланктона, зоопланктона, перифитона и зообентоса. Каждое из этих экологических сообществ наблюдается по целому ряду параметров.

По данным первичных наблюдений рассчитывают специальные обобщенные гидробиологические индексы, которые позволяют формализовать оценку качества вод по шестибалльной шкале: от I класса (очень чистые воды) до VI класса (очень грязные воды).

Влияние загрязнения на водные объекты можно выразить через категории экологических градаций, в которых могут находиться экосистемы. При этом по мере роста нагрузки загрязнения на водную среду наблюдаются последовательное ухудшение состояния водных экосистем.

Различаются следующие последовательные градации изменения состояния экосистем:

• экологическое благополучие;
• антропогенное экологическое напряжение;
• антропогенный экологический регресс;
• антропогенный метаболический регресс.

Комплексная оценка (с одной стороны - по качеству вод, а с другой стороны - через категории экологических градаций) позволяет наиболее полно охарактеризовать состояние экосистем.

Оценка состояния пресноводных экосистем по гидробиологическим показателям в 2009 году осуществлялась на 123 водных объектах России на 284 створах в пяти гидрографических районах.

Распределение наблюдаемых водных объектов по экологическому состоянию за последние пять лет представлено в таблице (в процентах от наблюдаемого количества водных объектов за каждый год, который берется за 100 %).

Результаты мониторинга свидетельствуют о том, что за последний год на поверхностных водах России наметилась тенденция к некоторому улучшению экологического состояния.

Таблица Тенденции в изменении экологического состояния водных объектов
по данным гидробиологического мониторинга

Экологическое состояние	Количество водных объектов (%)
	2004 г.	2005 г.	2006 г.	2007 г.	2008 г.	2009 г.
Экологическое благополучие	12	21	19	18	20	21
Антропогенное экологическое напряжение с элементами экологического регресса	62	73	68	74	55	44
Экологический и метаболический регресс	26	6	13	8	25	35
Всего	100	100	100	100	100	100